Die Geschäftsstelle des Gesundheitsfonds Steiermark führt die laufenden Geschäfte des Gesundheitsfonds Steiermark. Weitere wesentliche Aufgaben sind die Gesamtkoordination des intra- und extramuralen Bereichs, die Vorbereitung der Sitzungen und Koordinierung der Beschlüsse der Gesundheitsplattform sowie die Erstellung eines Voranschlags und Rechnungsabschlusses für die vom Gesundheitsfonds zu verwaltenden Mittel.

Laut § 6 Abs. 2 des Steirischen Gesundheitsfonds-Gesetzes ist das Amt der Landesregierung die Geschäftsstelle des Fonds. In der Geschäftsverteilung der Steiermärkischen Landesregierung wird die Geschäftsstelle des Gesundheitsfonds Steiermark organisatorisch der Abteilung 8 (Gesundheit, Veterinärwesen und Lebensmittelsicherheit) zugeordnet.

Die Leitung der Geschäftsstelle wird von den Geschäftsführern des Gesundheitsfonds Steiermark
Herrn Dipl.-Ing. Harald Gaugg und Herrn Dr. Gert Klima wahrgenommen.

Zur Weiterentwicklung des Gesundheitswesens werden Projekte des  Reformpools sowie  Projekte zur Gesundheitsförderung, Qualitätssicherungsmaßnahmen und Strukturplanung umgesetzt. Die Vernetzung erfolgt in österreichweit eingerichteten Arbeitsgruppen.